牙醫(yī)周汝川博士鑒于戰(zhàn)后臺灣的牙醫(yī)師人才奇缺，遂于1960年創(chuàng)設該校，初創(chuàng)之時只有牙科，名為中山牙科專科學校，簡稱中山牙專。1962年5月設醫(yī)科為中山醫(yī)學專科學校，簡稱中山醫(yī)專，其后再增設護理科與醫(yī)事技術科。牙科、醫(yī)科、護理科招收高中畢業(yè)生，牙科修業(yè)初為四年后延長為五年，醫(yī)科修業(yè)先為四年后延長為五年乃至六年，護理科修業(yè)為三年均屬三專學歷，醫(yī)技科招收初中畢業(yè)生修業(yè)五年，屬于五專學歷。

在1977年4月獲準昇格為學院，改名為中山醫(yī)學院。2001年7月教育部審核通過，正式改制為中山醫(yī)學大學，同年8月附設醫(yī)院也奉準改制更名為“中山醫(yī)學大學附設醫(yī)院”。

目前有醫(yī)學院、口腔醫(yī)學院、健康管理學院及醫(yī)學科技學院等四個學院，共有二十一個醫(yī)學相關科系、十八個研究所，其中七個科系有博士班。

中山醫(yī)大學生總數(shù)達7385人，于醫(yī)學大學中排名第二，僅次于中國醫(yī)大7410人（高醫(yī)大6896人，北醫(yī)大5840人，陽明大學4084人，慈濟大學3389人）