莆田學院附屬醫院是福建省最早的醫院之一，創建于1896年（清光緒廿二年），前身系英國教會創辦的“興化圣教醫院”，1912年改稱“莆田圣路加醫院”，1953年改名“莆田醫院”，2003年升格為“莆田學院附屬醫院”，2009年掛牌“南方醫科大學附屬莆田醫院”。

2012年經市委、市政府批準成立“莆田學院附屬醫院醫療集團”，現已發展成為一所集醫療、教學、科研、急救、預防、康復、保健為一體的國家級三甲醫院。現為國際緊急救援中心網絡醫院、國家級愛嬰醫院、國家級住院醫師規范化培訓基地、國家臨床藥師培訓基地、全國綜合醫院中醫藥工作示范單位、福建省道路交通事故傷員救治定點醫院、福建省城鎮職工醫療保險定點醫院、福建省醫保聯網醫院。

醫院（新舊兩區）占地總面積近300畝，總建筑面積24萬多平方米，開放床位2200張。現有教職員工2500余人，其中享受國務院政府特殊津貼專家4人，高級職稱410余人，省人事廳批準的教授、副教授47人，博士生導師和碩士生導師16人，博士后、博士及碩士320余人。設有68個臨床醫技科室，40個病區，52種專業。目前有1個院士工作站、17個市醫學分會及8個質控中心掛靠我院。目前年門診量170萬多人次，年出院病人8萬人次，年手術例數3萬多例，居全市之首。

醫院醫療、教學、科研相得益彰，是福建醫科大學、福建中醫藥大學教學醫院。2004年醫院與莆田學院臨床醫學系實現院系合一，現為莆田學院附屬臨床學院，設有7個醫學研究所、16個臨床教研室，1個醫學博士聯合培養點，9個醫學碩士聯合培養點。醫院與時俱進，不斷加大學科建設力度，以骨科、呼吸與危重癥醫學科2個省級重點專科以及胸心外科、感染性疾病科、兒童重癥醫學科等5個市級重點學科為龍頭，積極開展新技術、新療法、新項目，帶動各臨床學科全面發展，形成“院有品牌，科有特色，人有專長”的人才技術層次。

共有國家自然科學基金項目1項，衛生部科技二等獎1項，省政府科技二等獎、三等獎3項，省醫藥衛生及護理科技獎2項，先后有70多項科研項目獲市級科技進步獎。同時建立了福建省兒童救治和產前篩查診斷莆田分中心、莆田市生殖醫學中心。

醫院精神文明建設碩果累累，獲全國百名優秀愛嬰醫院、全國工人先鋒號、全國巾幗文明崗、全國青年文明號、全國五四紅旗單位，8次榮膺福建省文明單位，獲福建省先進基層黨組織、福建省衛生系統先進集體、福建省院務公開示范單位等稱號。