貴州醫科大學附屬醫院建于抗日烽煙中的1941年，由我國早期著名熱帶病學家、醫學教育家、時任國立貴陽醫學院院長、后調任北京協和醫院院長的李宗恩教授所創建。醫院創建伊始即云集了楊濟時、王季午、楊靜波、周裕德、沈克非、朱懋根、楊崇瑞等大批醫學精英。其中多數專家來自協和醫院，且醫院在辦院理念、規章制度、組織架構上亦多參照協和醫院，形成了診療規范、治學嚴謹的優良作風，在當時被人們譽為“小協和”。

截至2018年底，醫院有開放床位3200張，臨床學科55個、醫技科室19個，教研室18個，臨床醫學博士授予點3個，碩士學位授予點32個；國家臨床重點專科4個、國家藥物臨床試驗（GCP）專業25個（28個方向）、國家級基地13個，國家級重點研究室1個、全國名老中醫藥專家傳承工作室1個、國家級示范高級卒中中心1個、國家級胸痛中心1個、國家級心衰中心1個、國家級創新團隊1個、國家級教學團隊1個、國家緊急醫學救援隊1個、院士工作站3個，院士工作室9個，也是全國博士后科研工作站、國家干細胞研究機構、全國綜合醫院中醫藥工作示范單位；有省級臨床重點專科12個、省級特色重點學科1個、省區域內一流建設學科1個、貴州省一流專業建設項目2個、貴州省一流平臺建設項目1個、貴州省一流師資團隊建設項目3個、省級教學團隊1個、省級醫療質控中心22個、省級醫療中心16個、貴州省醫學研究機構3個、省級人才培訓基地15個、省級創新團隊9個。

醫院有職工4600余人，其中衛生技術人員4100余人，高級技術職稱900余人，碩士、博士1300余人，碩博導師400余人。有諾貝爾獎客座教授1人、合作院士9人、全國杰出專業技術人才1人、衛生部有突出貢獻中青年專家6人、國家百千萬人才工程3人、中國青年科技獎1人、中華醫學會終身成就獎4人、享受政府特殊津貼專家62人，省核心專家5人、省管專家17人、貴州省高層次創新型人才15人、貴州省十百千人才計劃4人、貴州省青年科技獎6人、貴州省青年創新人才獎2人。在中華醫學會的學術任職有全國副主委2人、全國常務委員6人、全國委員35人，在中國醫師協會的學術任職有全國主委1人、全國委員1人，在貴州省51個醫學會專科分會中，貴醫附院任職的主任委員有38個。

醫院還擁有貴州省唯一的伽瑪刀治療中心、PET/CT和雜交手術室等。國家緊急醫學救援隊（貴州）、貴州省緊急救援中心設立于貴醫附院，負責調度全省醫療急救資源，開展重大突發公共衛生事件的緊急救援。

在香港艾力彼醫院管理研究中心發布的“中國醫院競爭力排行”中，貴醫附院連續五年（2014/2015/2016/2017/2018）入選中國頂級醫院100強，是貴州省唯一入選的醫療機構。在復旦大學醫院管理研究所發布的“西南區醫院綜合實力排行榜”中，貴醫附院連續五年（2014/2015/2016/2017/2018）排位全省第一，進入西南排名前五的學科數量也是全省最多。在中國醫學科學院醫學信息研究所發布的“中國醫院科技影響力排行榜”中，醫院科技綜合實力連續三年（2016年、2017年、2018年）排名全省第一，進入全國100強的學科數量也是全省最多。