昆明市器官移植護理研究中心、昆明市腹腔鏡肝切除中心、昆明市角膜及眼表疾病診療技術中心、急危重癥及創傷救治中心、昆明市肝癌標準化診療中心、昆明市泌尿外科腔鏡技術研究機構、昆明市腦血管病治療技術中心、昆明市乳腺疾病診療技術中心、昆明市牙周種植技術中心、昆明市器官移植麻醉技術中心、昆明市大容量全肺灌洗技術中心、昆明市微創外科治療技術中心、昆明市血液凈化技術中心、昆明市健康體檢中心、昆明市肺部感染診療技術中心 、肺血栓栓塞診治中心，昆明市甲狀腺疾病診療中心。

五個市級內設研究機構：昆明市心血管病研究中心、昆明市肝膽胰外科研究中心、昆明市醫學檢驗研究中心、昆明市創傷骨科研究中心、昆明市干細胞研究中心。一個市級中醫“中風病”專病建設。

為引進新的理念、思路和技術，提高綜合竟爭實力，醫院與國內外醫學院校、醫療集團建立了一系列合作關系:與法國巴黎第五大學醫學院簽訂了合作共建協議；與法國尼斯、利摩日醫療集團簽訂了長期的人員互訪交流合作協議；與美國善福德醫療集團簽訂了合作共建國際兒科診所的協議；與臺灣義大醫院建立了友好合作關系，同時，我院是老撾衛生部與昆明市衛計委簽訂《友好合作諒解備忘錄》的主要合作單位。

醫院以學科、技術、科研、管理、人才梯隊建設為支撐，以器官移植、干細胞臨床應用、微創外科、內分泌系統疾病、心腦血管系統疾病、老年病診治及康復保健為導向，以重點學科為龍頭，按照“抓重點、破難點、創亮點”的發展需要，加大重點學科、重點專科、重點實驗室建設，在醫療服務和管理水平方面實現跨越式發展。

擁有達芬奇機器人手術系統、1.5T核磁共振、128排螺旋CT、數字減影血管造影機、數字X射線系統、人工肝支持系統、氬氣刀、超吸刀、肝纖維檢測儀、骨密度檢測儀等大型先進設備。

衛生部首批三級甲等綜合性醫院、全國“百佳醫院”、昆明地區“十佳醫院”、省級文明單位、醫德醫風先進單位。