1981 年學(xué)校獲得國務(wù)院學(xué)位委員會學(xué)士學(xué)位和碩士學(xué)位授予權(quán)；1998 年一次性通過教育部本科教學(xué)工作合格評價；2008 年順利通過教育部本科教學(xué)工作水平評估并獲優(yōu)秀等級。

在長期辦學(xué)歷程中，學(xué)校涌現(xiàn)出一批誨人不倦的知名教授。有創(chuàng)建了我國首個神經(jīng)病專科病房、撰寫首部神經(jīng)精神專著的劉貽德教授；有我國定量藥理學(xué)創(chuàng)始人之一的孫瑞元教授；有潛心本草研究六十載，輯復(fù)了經(jīng)典名著《新修唐本草》的尚志鈞教授；有國醫(yī)大師、全國七名內(nèi)經(jīng)專業(yè)導(dǎo)師之一的李濟仁教授；有德技雙馨、我校捐贈遺體第一人的汪桐教授。更有一大批愛崗敬業(yè)的優(yōu)秀教師、勞動模范、學(xué)科帶頭人和骨干教師。正是一代代皖醫(yī)人的薪火相傳、無私奉獻，奠定了學(xué)校事業(yè)發(fā)展的基礎(chǔ)，成為學(xué)校最寶貴的辦學(xué)資源。

學(xué)校現(xiàn)有濱江、赭麓、銀湖三個校區(qū)，占地101.13萬平方米，各類建筑面積40 余萬平方米。濱江校區(qū)瀕臨長江，綠水環(huán)繞，設(shè)施齊全，環(huán)境優(yōu)美，徽派建筑風(fēng)格與現(xiàn)代氣息相得益彰，也是學(xué)校辦學(xué)的主校區(qū)。學(xué)校設(shè)有16 個二級學(xué)院、2 所直屬附院、6 所非直屬附院。其中，第一附屬醫(yī)院（皖南醫(yī)學(xué)院弋磯山醫(yī)院）始建于1888 年，由美國基督教會創(chuàng)辦，為安徽省第一所西醫(yī)醫(yī)院和全國首批三級甲等醫(yī)院，是皖南及皖江地區(qū)醫(yī)療、預(yù)防、康復(fù)、急救的中心。該院于1926 年創(chuàng)辦“蕪湖醫(yī)院護士學(xué)校”，1936 年更名為“蕪湖醫(yī)院懷讓高級護士職業(yè)學(xué)校”，曾在國內(nèi)享有很高的聲譽，時有“北協(xié)和、南懷讓”之稱。

學(xué)校本科教育涵蓋醫(yī)、理、工、管、經(jīng)、法6 個學(xué)科門類，設(shè)有26 個專業(yè)。研究生教育涉及醫(yī)學(xué)、理學(xué)2 個學(xué)科門類，其中，一級學(xué)科授權(quán)點4個，專業(yè)學(xué)位授權(quán)類別5 個，二級學(xué)科授權(quán)點29 個（含一級學(xué)科覆蓋點）。有國家級特色專業(yè)1 個、省級特色專業(yè)9 個、國家級專業(yè)綜合改革試點專業(yè)1 個、省級專業(yè)綜合改革試點專業(yè)11 個，省級重點學(xué)科2 個、“十三五”省臨床優(yōu)先發(fā)展重點專科1 個、省臨床重點專科3 個、省臨床重點培育專科2 個。

學(xué)校重視師資隊伍建設(shè)和學(xué)科帶頭人培養(yǎng)。現(xiàn)有教職醫(yī)護員工4000余人，其中專任教師656人，包括高級職稱276人。近年來有7 名教師分別榮膺全國、全省優(yōu)秀教師光榮稱號，13 人享受國務(wù)院特殊津貼，現(xiàn)有省高校學(xué)科拔尖人才2 人，省學(xué)術(shù)和技術(shù)帶頭人7 人、后備人選13 人。

學(xué)校注重教學(xué)科研團隊和平臺建設(shè)。現(xiàn)有國家級虛擬仿真實驗教學(xué)項目1 個，省級人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實驗區(qū)1 個，省級教學(xué)團隊8 個，省級卓越人才教育培養(yǎng)計劃7 項，省級精品資源課程23 門，省級示范實驗實訓(xùn)中心3 個。有國家藥物臨床試驗機構(gòu)1個、國家中醫(yī)藥管理局三級實驗室1 個、省級重點實驗室等省級科研平臺4 個、省級校企合作實踐教育基地4 個，公開出版《皖南醫(yī)學(xué)院學(xué)報》《中國臨床藥理學(xué)與治療學(xué)》2 種學(xué)術(shù)期刊。

學(xué)校積極開展對外交流與合作，先后與美國、英國、德國等國家以及香港、臺灣地區(qū)的高校及研究機構(gòu)廣泛開展學(xué)術(shù)合作交流；與美國Barrow神經(jīng)病研究所、安徽海關(guān)（原安徽出入境檢驗檢疫局）、南京軍區(qū)南京總醫(yī)院、先聲藥業(yè)集團等國內(nèi)企事業(yè)單位和科研院所開展實踐教學(xué)、科研攻關(guān)等方面的合作。

學(xué)校始終堅持人才培養(yǎng)中心地位，深化實踐教育、社會責(zé)任教育和創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)教育“三位一體”人才培養(yǎng)模式改革，促進人才培養(yǎng)質(zhì)量不斷提高。畢業(yè)生深受用人單位和社會各界好評，就業(yè)率始終保持在97％以上，位居全省高校前列，多次榮獲省就業(yè)工作先進單位稱號。建校以來，已為國家輸送了近六萬名醫(yī)療衛(wèi)生人才，為我省乃至全國的醫(yī)療衛(wèi)生事業(yè)發(fā)展作出了積極的貢獻。

自辦學(xué)以來，學(xué)校秉承“精醫(yī)、尚德、求實、自強”的校訓(xùn)，發(fā)揚“艱苦創(chuàng)業(yè)，求實自強，奉獻社會”的皖醫(yī)精神，形成了優(yōu)良的辦學(xué)傳統(tǒng)。站在新的歷史起點上，學(xué)校將以習(xí)近平新時代中國特色社會主義思想為指導(dǎo)，繼續(xù)秉承優(yōu)良辦學(xué)傳統(tǒng)，堅持“以本為本”，堅持“四個回歸”，堅持內(nèi)涵式發(fā)展，全面提升辦學(xué)實力和人才培養(yǎng)質(zhì)量，辦好人民滿意的大學(xué)，為建設(shè)“五大發(fā)展”美好安徽、服務(wù)人民大眾健康、全面小康做出新的更大貢獻。